Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms