Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms