Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4P13236 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL4P13236 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms