Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI3P10071 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI3P10071 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI3P10071 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI3P10071 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI3P10071 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms