Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF14O43557 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms