Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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