Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK3Q9UBP4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms