Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms