Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC11Q9BVV2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms