Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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