Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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