Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms