Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TTPAP49638 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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