Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYBBP04839 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms