Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms