Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT140Q96RY7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT140Q96RY7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms