Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms