Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEN1Q17RS7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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