Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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