Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms