Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms