Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms