Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSPNQ9HAW4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms