Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms