Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms