Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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