Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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