Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOS1Q07889 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms