Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms