Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB1P14653 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms