Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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