Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC6Q9UBN7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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