Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC4Q9NTJ3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC4Q9NTJ3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms