Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms