Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EP400Q96L91 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms