Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM41Q8WV44 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms