Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms