Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms