Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms