Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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NTRK3Q16288 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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