Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
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