Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCIRG1Q13488 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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