Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM28Q13263 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM28Q13263 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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