Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms