Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLCSP50747 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLCSP50747 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLCSP50747 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms