Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPFP49454 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPFP49454 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms