Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms