Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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