Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms