Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms